L'étude attentive des pratiques montre que la répartition des charges indirectes présente d'importants aspects comportementaux. L'influence sur les comportements se fait à travers trois mécanismes différents. D'abord, dans un contexte d'agence, la répartition est un instrument employé par le principal pour contrôler l'activité de l'agent. Il s'agit d'une contrainte imposée par le principal afin de limiter les comportements aberrants de l'agent ou, plus exactement, inciter celui-ci à agir pour maximiser le bien-être du principal. La répartition des charges joue donc le même rôle que les dépenses de surveillance et d'incitation engagées par le principal dans le modèle de l'agence. Ensuite, l'allocation des coûts fonctionne comme un système fiscal interne qui vise à réduire les gaspillages de ressources. Les charges réparties exercent une pression psychologique sur les managers commerciaux, en les incitant à prendre des mesures pour améliorer l'efficience des centres de profit (accroissement des marges brutes ou réduction des charges opérationnelles). Finalement, la répartition des charges est étroitement liée à la solidarité et à la cohésion interne de l'organisation. La relation est double. Premièrement, la répartition est un facteur d'intégration qui favorise le partage des responsabilités et encourage la coopération entre départements (surtout entre départements de supports et départements commerciaux). Deuxièmement, en sens inverse, la solidarité interne crée les prémisses pour une motivation efficace des acteurs à travers la répartition des charges. Ces trois mécanismes sont contingents, ils semblent mieux adaptés dans un environnement incertain et hostile. Il ne faut pas considérer la répartition des charges indirectes comme un processus inexorable dans la vie de l'entreprise. Dans tous les cas, la décision de répartir ou non et, le cas échéant, la méthode de répartition mise en place, procèdent d'un choix managérial, le plus souvent conscient, dont les raisons sont diverses et profondes.